Als der fiese Stryfe mit Logans Hilfe seinen vermissten Helm auffindet, werden Wade und Wolverine mit einer apokalyptischen Aussicht konfrontiert. Dank dem Legacy-Virus 2.0 sind die beiden Helden nicht immer Herr ihrer Sinne. Während Deadpool mit dem Söldner Maverick versucht, den Planeten vor einer dystopischen Zukunft zu retten, betritt ein neuer Mutant die Bühne. Aber auf welcher Seite wird er stehen?